Vanliga processorer är en kompromiss, men grafikprocessorer är specialister.

Man kan tro att grafikprocessorer är bra på att rita, men vad de verkligen gör är extremt snabba beräkningar. Inte enkla men långtråkiga beräkningar som i ett kalkylark, utan krångliga uträkningar av det slag som vetenskapsmän behöver hjälp med.Dessutom är de strömsnåla. Det har forskare på KTH i Stockholm tagit fasta på och utvecklat ett alternativ till vanliga superdatorer, som vanligtvis består av hundratals eller tusentals vanliga Intel- eller AMD-processorer.

Det är Erik Lindahl, Berk Hess och Szilárd Páll som arbetat fram en plattform för att använda grafikprocessorer till avancerade matematiska beräkningar.

Från början handlade det om proteiner. De tre forskarna deltog i projektet Folding@home, ett forskningsprojekt om proteiner och proteinveckning. Simulering av proteinveckning kräver kraftfulla datorer, och möjligheterna med grafikprocessorer var kända sedan länge, så de tre svenska forskarna tittade på den möjligheten.

– Grafikprocessorer har superbra prestanda jämfört med superdatorernas processorer, säger Erik Lindahl till KTH.

Problemet är att grafikprocessorer är krångliga att programmera. Uppgiften blev därför att utveckla ett program för att underlätta beräkningar med grafikprocessorer. I samarbete med Nvidia, tillverkare av grafikprocessorer, superdatortillverkaren Cray och Schweiz nationella superdatorcenter utvecklade de programmet Gromacs.

Forskarna kan nu inte bara ta fram stillbilder av proteinstrukturer, de kan visa veckningen som en film.


Fakta

Så länge har Windows XP varit i bruk den 8 april 2014, som är den sista dag Microsoft ger support och säkerhetsuppdaterar för systemet. Det är 2,5 år längre än vad som är normalt för ett operativsystem från Microsoft.

Den tidigare rekordhållaren Windows NT mäktade med elva år och fem månader.

Även Office 2003 slutar supportas den dagen. Både XP och Office 2003 har varit kassakor för Microsoft sedan de lanserades i oktober 2001 respektive oktober 2003. Vissa företag räknar med att fortsätta använda XP även efter att all support upphör.

I en undersökning som genomfördes av Gartner i oktober förra året svarade 16 procent att fler än fem procent av deras användare kommer att fortsätta köra XP även efter att supporten upphört.

Grafikprocessorernas kapacitet behövs för att beräkna proteinveckning. Det är när proteinmolekylen, som egentligen är en lång sträng av atomer, vecklar ihop sig som en rulle taggtråd. Det är en känslig process, eftersom ett fel i proteinveckningen kan ge proteinmolekylen fel egenskaper. De molekyler som hamnar ytterst interagerar med yttervärlden, så det är viktigt att proteinveckningen blir likadan varje gång.

Forskningen om proteiner och proteinveckning kan ge oss nya och bättre läkemedel mot sjukdomar som Alzheimer, Parkinsons och cancer.